A regional Vale do Guaporé está localizada no Oeste do Estado de Mato Grosso e é composta por dois povos indígenas, Chiquitano e Nambikwara.

Esta região congrega uma articulação de onze povos indígenas, que ocupam diversas terras no noroeste do Estado. Esta região faz parte do Corredor Etnoambiental Tupi Mondé, entre os estados de Mato Grosso e Rondônia.

Esta região abrange terras indígenas ocupadas principalmente pelos povos Bororo, Bakairi, Umutina, Paresí, Guató e Nambikwara do Cerrado, nas sub-bacia do Rio Paraguai, sub – bacia do Teles Pires, já em transição entre os ecossistemas de cerrado e o pantanal mato-grossense.

A regional Xingu é um corredor etnoambiental que abrange uma extensão de cerca de 2,8 mil hectares, englobando as terras indígenas do Xingu. Esse corredor se estende numa transição ecológica, englobando ecossistemas de savanas, florestas e cerrados. Ao todo, essa região congrega 16 povos.

Este conglomerado de terras indígenas pertencentes ao povo Xavante inclui a maioria dos territórios do sudeste de Mato Grosso e a TI Marãiwatsédé, localizada mais ao norte, abarcando os biomas Cerrado, Amazônia e matas de transição. Ao todo, são nove territórios, descontínuos, habitados por essa etnia.

Esta região inclui terras indígenas dos povos Tapirapé, Karajá, Krenak e Maxacali, situadas na confluência dos rios Xingu e Araguaia e na divisa dos estados de Mato Grosso e Tocantins, incluindo a maior ilha fluvial do mundo, a Ilha do Bananal, em um frágil Bioma de Cerrado, florestas, matas de transição e Pantanal do Araguaia.

Esta região inclui povos Guarani, Terena, Kaiabi, Apiaká, Munduruku, Kayapó, Trumai, Tapajuna, Juruna e Panará. As Terras Indígenas Menkragnoti (Kayapó), ambas na região do Rio Iriri, têm suas áreas divididas entre Mato Grosso e Pará. A porção que se situa no Estado do Mato Grosso é de 131, 1 mil hectares. Já a porção no Pará é de 113 mil hectares.